Von 1844 bis 1846 erschienen vier Hefte der Zeitschrift für wissenschaftliche Botanik, herausgegeben von Matthias Jacob Schleiden und Carl Wilhelm von Nägeli. Die Gründung und Herausgabe der Zeitschrift erfolgte aufgrund der gemeinsamen Arbeit der Herausgeber an der Universität Jena (Nägeli war von 1842-1843 ein Schüler von Schleiden) und hatte den Anspruch in der Entwicklungsgeschichte der Botanik ein "bewegendes Moment" einnehmen und eine "wissenschaftlich-induktive" Botanik zu fördern. Die Beiträge stammen grösstenteils von Nägeli selbst und umfassen u.a. einige bedeutende Beobachtungen zu Gesetzmässigkeiten des Zellenaufbaus bei Pflanzen. 1846 wurde die Zeitschrift eingestellt.